عندها يبدأ الطلاب بتقديم رغباتهم وذلك حسب مجاميعهم و حسب نتائج المفاضلة الأولى حيث يحق لكل طالب بتقديم خمسة عشر رغبة إلى عشرون رغبة وذلك حسب الشهادة ويستمر الطلاب بتقديم رغباتهم لحوالي عشرة أيام وعندها تبدأ وزارة التعليم العالي الاستعداد لإصدار نتائج المفاضلة الثانية و التي تحدد الحدود الدنيا للقبول في كل كلية و يتم توزيع الطلاب على الكليات ليبدأ كل طالب بالتسجيل في الكلية المقبول فيها وبعد فترة يتم إصدار نتائج القبول للطلاب الشبيبيين الذين خضعوا لمعسكر شبيبي ما وكذلك مفاضلة التعليم الموازي التي تكون فيها الحدود الدنيى للمجموع أخفض من الحدود الدنيا للمفاضلة الثانية ولكن يجب على الطالب الذي يريد تقديم رغباته بناءاً على هذه المفاضلة أن يدفع قسط سنوي من المال يختلف هذا القسط من كلية لأخرى.